Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIN6

Kcnmb4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb4Q9JIN6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Kcnmb4Q9JIN6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Kcnmb4Q9JIN6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Kcnmb4Q9JIN6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Kcnmb4Q9JIN6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Kcnmb4Q9JIN6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Kcnmb4Q9JIN6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Kcnmb4Q9JIN6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Kcnmb4Q9JIN6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Kcnmb4Q9JIN6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnmb4Q9JIN6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kcnmb4Q9JIN6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kcnmb4Q9JIN6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnmb4Q9JIN6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnmb4Q9JIN6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnmb4Q9JIN6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnmb4Q9JIN6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnmb4Q9JIN6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnmb4Q9JIN6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnmb4Q9JIN6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms