Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc22Q9JIG7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms