Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf2ird1Q9JI57 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf2ird1Q9JI57 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf2ird1Q9JI57 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf2ird1Q9JI57 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf2ird1Q9JI57 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gtf2ird1Q9JI57 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms