Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW4

Eefsec, Selenocysteine-specific elongation factor, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EefsecQ9JHW4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EefsecQ9JHW4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EefsecQ9JHW4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms