Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tcirg1Q9JHF5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tcirg1Q9JHF5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms