Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN4

C1ql3, Complement C1q-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1ql3Q9ESN4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1ql3Q9ESN4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C1ql3Q9ESN4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C1ql3Q9ESN4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C1ql3Q9ESN4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C1ql3Q9ESN4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1ql3Q9ESN4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1ql3Q9ESN4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1ql3Q9ESN4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1ql3Q9ESN4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1ql3Q9ESN4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1ql3Q9ESN4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1ql3Q9ESN4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1ql3Q9ESN4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C1ql3Q9ESN4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1ql3Q9ESN4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1ql3Q9ESN4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1ql3Q9ESN4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C1ql3Q9ESN4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C1ql3Q9ESN4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1ql3Q9ESN4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1ql3Q9ESN4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C1ql3Q9ESN4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1ql3Q9ESN4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1ql3Q9ESN4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1ql3Q9ESN4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C1ql3Q9ESN4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1ql3Q9ESN4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1ql3Q9ESN4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1ql3Q9ESN4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1ql3Q9ESN4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1ql3Q9ESN4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C1ql3Q9ESN4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1ql3Q9ESN4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1ql3Q9ESN4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1ql3Q9ESN4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1ql3Q9ESN4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1ql3Q9ESN4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1ql3Q9ESN4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C1ql3Q9ESN4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms