Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
OtofQ9ESF1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
OtofQ9ESF1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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