Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
DysfQ9ESD7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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DysfQ9ESD7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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DysfQ9ESD7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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DysfQ9ESD7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
DysfQ9ESD7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms