Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc4Q9ES56 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms