Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Capn12Q9ER56 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn12Q9ER56 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms