Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPS4

Vmn1r172, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r172Q9EPS4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r172Q9EPS4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r172Q9EPS4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r172Q9EPS4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r172Q9EPS4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r172Q9EPS4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r172Q9EPS4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r172Q9EPS4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r172Q9EPS4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r172Q9EPS4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r172Q9EPS4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r172Q9EPS4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r172Q9EPS4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r172Q9EPS4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r172Q9EPS4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r172Q9EPS4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r172Q9EPS4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r172Q9EPS4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r172Q9EPS4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r172Q9EPS4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r172Q9EPS4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r172Q9EPS4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r172Q9EPS4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r172Q9EPS4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r172Q9EPS4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r172Q9EPS4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r172Q9EPS4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r172Q9EPS4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r172Q9EPS4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r172Q9EPS4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r172Q9EPS4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r172Q9EPS4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r172Q9EPS4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r172Q9EPS4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r172Q9EPS4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r172Q9EPS4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r172Q9EPS4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r172Q9EPS4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r172Q9EPS4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r172Q9EPS4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r172Q9EPS4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r172Q9EPS4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r172Q9EPS4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r172Q9EPS4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r172Q9EPS4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r172Q9EPS4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r172Q9EPS4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r172Q9EPS4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r172Q9EPS4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms