Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK8

Trpv4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv4Q9EPK8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trpv4Q9EPK8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpv4Q9EPK8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trpv4Q9EPK8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms