Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ndufs3Q9DCT2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ndufs3Q9DCT2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ndufs3Q9DCT2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms