Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pop7Q9DCH2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pop7Q9DCH2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pop7Q9DCH2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pop7Q9DCH2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pop7Q9DCH2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pop7Q9DCH2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pop7Q9DCH2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pop7Q9DCH2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pop7Q9DCH2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pop7Q9DCH2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pop7Q9DCH2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pop7Q9DCH2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pop7Q9DCH2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pop7Q9DCH2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pop7Q9DCH2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pop7Q9DCH2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pop7Q9DCH2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pop7Q9DCH2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pop7Q9DCH2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pop7Q9DCH2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pop7Q9DCH2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pop7Q9DCH2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pop7Q9DCH2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pop7Q9DCH2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pop7Q9DCH2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pop7Q9DCH2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pop7Q9DCH2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pop7Q9DCH2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pop7Q9DCH2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pop7Q9DCH2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pop7Q9DCH2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pop7Q9DCH2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pop7Q9DCH2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms