Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmg20aQ9DC33 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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