Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syde1Q9DBZ9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms