Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc97Q9DBT3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms