Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fundc1Q9DB70 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fundc1Q9DB70 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms