Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAG9

Phf7, PHD finger protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf7Q9DAG9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf7Q9DAG9 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf7Q9DAG9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf7Q9DAG9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf7Q9DAG9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf7Q9DAG9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf7Q9DAG9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf7Q9DAG9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf7Q9DAG9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf7Q9DAG9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf7Q9DAG9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf7Q9DAG9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Phf7Q9DAG9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf7Q9DAG9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf7Q9DAG9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf7Q9DAG9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf7Q9DAG9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf7Q9DAG9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf7Q9DAG9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf7Q9DAG9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf7Q9DAG9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf7Q9DAG9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf7Q9DAG9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Phf7Q9DAG9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Phf7Q9DAG9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms