Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9DA42 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9DA42 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9DA42 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9DA42 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9DA42 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9DA42 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9DA42 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9DA42 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9DA42 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9DA42 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9DA42 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9DA42 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9DA42 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9DA42 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9DA42 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DA42 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DA42 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DA42 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DA42 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DA42 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DA42 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DA42 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DA42 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DA42 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DA42 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DA42 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DA42 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DA42 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DA42 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DA42 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DA42 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DA42 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DA42 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DA42 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DA42 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DA42 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DA42 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DA42 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DA42 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DA42 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DA42 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DA42 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DA42 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DA42 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DA42 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DA42 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DA42 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DA42 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DA42 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DA42 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DA42 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DA42 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DA42 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DA42 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DA42 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DA42 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DA42 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DA42 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DA42 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DA42 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DA42 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DA42 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DA42 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DA42 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DA42 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DA42 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DA42 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DA42 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DA42 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DA42 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DA42 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DA42 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DA42 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DA42 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DA42 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DA42 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DA42 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DA42 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DA42 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DA42 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DA42 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DA42 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DA42 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DA42 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DA42 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DA42 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DA42 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DA42 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DA42 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DA42 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DA42 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DA42 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DA42 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DA42 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DA42 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DA42 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DA42 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DA42 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DA42 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms