Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Samd8Q9DA37 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Samd8Q9DA37 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms