Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms