Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms