Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4bQ9D9F7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Speer4bQ9D9F7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms