Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms