Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg7Q9D906 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Atg7Q9D906 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms