Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cnot8Q9D8X5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms