Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tvp23bQ9D8T4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tvp23bQ9D8T4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms