Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D8Q6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D8Q6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D8Q6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D8Q6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D8Q6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D8Q6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D8Q6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D8Q6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D8Q6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D8Q6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D8Q6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D8Q6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D8Q6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Q9D8Q6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8Q6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8Q6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8Q6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8Q6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8Q6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8Q6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8Q6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8Q6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8Q6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8Q6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8Q6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8Q6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8Q6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8Q6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8Q6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8Q6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8Q6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8Q6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8Q6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8Q6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8Q6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8Q6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8Q6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8Q6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8Q6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Q9D8Q6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D8Q6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D8Q6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D8Q6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D8Q6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D8Q6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q9D8Q6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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