Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rpl4Q9D8E6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms