Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jam3Q9D8B7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms