Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Capn9Q9D805 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn9Q9D805 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms