Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmigd1Q9D7L8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms