Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I0

Shisa5, Protein shisa-5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa5Q9D7I0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Shisa5Q9D7I0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Shisa5Q9D7I0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms