Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn23Q9D7D7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn23Q9D7D7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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