Protein–RNA interactions for Protein: Q9D709

Tmem79, Transmembrane protein 79, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem79Q9D709 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem79Q9D709 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem79Q9D709 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem79Q9D709 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem79Q9D709 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem79Q9D709 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem79Q9D709 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem79Q9D709 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem79Q9D709 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem79Q9D709 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem79Q9D709 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem79Q9D709 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem79Q9D709 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem79Q9D709 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem79Q9D709 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem79Q9D709 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem79Q9D709 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem79Q9D709 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem79Q9D709 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem79Q9D709 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem79Q9D709 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem79Q9D709 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem79Q9D709 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem79Q9D709 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms