Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gbe1Q9D6Y9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms