Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Ccdc94Q9D6J3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms