Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ptp4a3Q9D658 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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Ptp4a3Q9D658 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ptp4a3Q9D658 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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