Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc130Q9D516 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms