Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc83Q9D4V3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms