Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lonrf3Q9D4H7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms