Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubgcp4Q9D4F8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubgcp4Q9D4F8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubgcp4Q9D4F8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubgcp4Q9D4F8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubgcp4Q9D4F8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubgcp4Q9D4F8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubgcp4Q9D4F8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubgcp4Q9D4F8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubgcp4Q9D4F8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubgcp4Q9D4F8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubgcp4Q9D4F8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubgcp4Q9D4F8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubgcp4Q9D4F8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubgcp4Q9D4F8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubgcp4Q9D4F8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubgcp4Q9D4F8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tubgcp4Q9D4F8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tubgcp4Q9D4F8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tubgcp4Q9D4F8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tubgcp4Q9D4F8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tubgcp4Q9D4F8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Tubgcp4Q9D4F8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tubgcp4Q9D4F8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tubgcp4Q9D4F8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tubgcp4Q9D4F8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms