Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms