Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt20Q9D312 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt20Q9D312 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms