Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2A5

Creb3l4, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l4Q9D2A5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Creb3l4Q9D2A5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Creb3l4Q9D2A5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms