Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trappc6bQ9D289 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc6bQ9D289 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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