Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Susd3Q9D176 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Susd3Q9D176 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Susd3Q9D176 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Susd3Q9D176 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Susd3Q9D176 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Susd3Q9D176 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Susd3Q9D176 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Susd3Q9D176 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Susd3Q9D176 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Susd3Q9D176 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Susd3Q9D176 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Susd3Q9D176 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Susd3Q9D176 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Susd3Q9D176 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Susd3Q9D176 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Susd3Q9D176 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Susd3Q9D176 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Susd3Q9D176 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Susd3Q9D176 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Susd3Q9D176 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Susd3Q9D176 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Susd3Q9D176 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Susd3Q9D176 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Susd3Q9D176 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Susd3Q9D176 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Susd3Q9D176 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Susd3Q9D176 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms