Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem53Q9D0Z3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms