Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zbed3Q9D0L1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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